1982 yılında Eğitim Fakültelerinin kurulması ile birlikte Kimya Eğitimi anabilim dalı olarak KTÜ Fatih Eğitim Fakültesi Fen Bilimleri Eğitimi Bölümü bünyesinde yer aldı. 1998 yılına kadar kimya öğretmeni yetiştirmek amacıyla 4 yıllık lisans programı yürüttü. 1998 yılındaki eğitim fakültelerinin yeniden yapılandırılması projesi sonucunda yürürlüğe giren uygulama ile birlikte kimya öğretmeni yetiştirmek amacıyla 5 yıllık lisans eğitimi vermeye başladı. Ancak 2014 yılında 4 yıllık lisans eğitiminin verilmesi yönünde bir kararın alınmasıyla birlikte kimya öğretmeni yetiştirmek amacıyla tekrar 4 yıllık lisans programı yürütülmeye başlandı. Ayrıca Yükseköğretim Kurulu Başkanlığının 17.06.2016 tarihli 36826 sayılı yazısında belirtilen karara göre Matematik ve Fen Bilimleri Eğitimi Bölümü bünyesinde yer almaya başlamıştır. 2018 yılında kurulan Trabzon Üniversitesi'ne dahil oldu. Kimya programında bulunan alan dersleri, Trabzon Üniversitesinde fen fakültesi olmaması nedeniyle, KTÜ Fen Fakültesinin kimya bölümündeki öğretim elemanlarından destek alınarak yürütülmektedir. Diğer dersler anabilim dalındaki öğretim üyeleri tarafından yürütülmektedir.